Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms