Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col17a1Q07563 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms