Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms