Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms