Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms