Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms