Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Msx2Q03358 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms