Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms