Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ascl1Q02067 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms