Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms