Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmgcrQ01237 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms