Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms