Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeleQ00690 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms