Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabpaQ00422 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GabpaQ00422 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms