Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cited1P97769 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms