Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim43bP86448 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms