Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms