Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx3P81067 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms