Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiitaP79621 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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