Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf3P70671 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms