Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pkn1P70268 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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