Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms