Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms