Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms