Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms