Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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