Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl8P62918 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms