Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms