Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms