Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms