Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms