Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms