Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Senp1P59110 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp1P59110 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Senp1P59110 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms