Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms