Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P58686 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P58686 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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P58686 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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P58686 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P58686 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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P58686 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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P58686 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P58686 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P58686 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P58686 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P58686 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P58686 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P58686 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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P58686 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P58686 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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P58686 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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P58686 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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P58686 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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P58686 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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