Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcstnP57716 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NcstnP57716 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcstnP57716 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcstnP57716 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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