Protein–RNA interactions for Protein: P56845

Tcl1b5, Protein TCL1B5, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcl1b5P56845 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tcl1b5P56845 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms