Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms