Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClgnP52194 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClgnP52194 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClgnP52194 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClgnP52194 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms