Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Apobec1P51908 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Apobec1P51908 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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