Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a1P51906 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a1P51906 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms