Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr5P51682 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms