Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms