Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms