Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms