Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VdrP48281 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
VdrP48281 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VdrP48281 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VdrP48281 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms