Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl13P47963 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms