Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms