Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gdf6P43028 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gdf6P43028 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf6P43028 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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