Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VhlP40338 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VhlP40338 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VhlP40338 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VhlP40338 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms